Novela zákona o DPH od ledna 2025 přináší řadu změn. Jedním z hlavních témat je transpozice evropské směrnice týkající se režimu malých podniků, kdy malé podniky se sídlem v jiném členském státě EU, které nepřekročí za kalendářní rok tuzemský obrat 2 mil. Kč, nebudou v ČR spadat do režimu DPH. Totéž platí pro české malé podniky, které budou chtít využít osvobození v jiných členských státech. Podmínkou využití je registrace.
Se zavedením režimu pro malé podniky souvisí změna v počítání obratu pro registraci k DPH, kdy se obrat bude sledovat za kalendářní rok (do 31.12.2024 se sledovalo 12 po sobě jdoucích měsíců). Pokud dojde k překročení obratu 2 mil. Kč, je povinnost podat přihlášku k DPH do 10 pracovních dnů od data překročení obratu, avšak plátcem se daňový subjekt stává až od 1. ledna následujícího roku. Musí ale sledovat ještě druhý limit, a to částku 2.536.000,- Kč (ekvivalent 100 tis. EUR platný v celé EU), jehož překročení znamená okamžitý vznik plátcovství od následujícího dne po překročení.
Dochází ke zkrácení lhůty pro uplatnění nároku na odpočet a to do dvou let od vzniku nároku na odpočet. Opravu daně, např. při snížení ceny z důvodu reklamace, bude naopak možné provést až do konce sedmého kalendářního roku po roce uskutečněného zdanitelného plnění. Dlužníci v případě prodlení více než 6 měsíců od splatnosti budou vracet daň na vstupu. Naopak věřitelé budou mít možnost snížit daň na výstupu u bagatelních pohledávek po lhůtě splatnosti více než 6 měsíců. Začínají platit nová pravidla pro uplatnění odpočtu v poměrné výši, např. v při použití obchodního majetku i pro soukromé účely.
K dalším změnám dojde od 1.7.2025 a to především v uplatnění DPH u převodu nemovitostí.